Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMYD3Q9H7B4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SMYD3Q9H7B4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms