Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH2D4AQ9H788 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH2D4AQ9H788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms