Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BCAS3Q9H6U6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BCAS3Q9H6U6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms