Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LHX5Q9H2C1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LHX5Q9H2C1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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