Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CCDC90BQ9GZT6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC90BQ9GZT6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms