Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CEP44Q9C0F1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CEP44Q9C0F1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms