Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ROPN1BQ9BZX4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROPN1BQ9BZX4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROPN1BQ9BZX4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROPN1BQ9BZX4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ROPN1BQ9BZX4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ROPN1BQ9BZX4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms