Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFIH1Q9BYX4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFIH1Q9BYX4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms