Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms