Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SNHG12Q9BXW3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms