Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRRTQ9BXP5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SRRTQ9BXP5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms