Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PLVAPQ9BX97 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PLVAPQ9BX97 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms