Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BRIP1Q9BX63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRIP1Q9BX63 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms