Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSBP4Q9BWG4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms