Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RIOK2Q9BVS4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RIOK2Q9BVS4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms