Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PBDC1Q9BVG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PBDC1Q9BVG4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms