Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUB5

MKNK1, MAP kinase-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKNK1Q9BUB5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MKNK1Q9BUB5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MKNK1Q9BUB5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms