Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SIKE1Q9BRV8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SIKE1Q9BRV8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms