Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIOK1Q9BRS2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RIOK1Q9BRS2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms