Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SRSF8Q9BRL6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms