Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MESP1Q9BRJ9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms