Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CITED2Q99967 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CITED2Q99967 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms