Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP19Q99542 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MMP19Q99542 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms