Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORT1Q99523 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORT1Q99523 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms