Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRAM1Q96QH2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PRAM1Q96QH2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms