Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC4A9Q96Q91 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC4A9Q96Q91 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms