Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NLRP3Q96P20 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NLRP3Q96P20 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms