Protein–RNA interactions for Protein: Q96NM4

TOX2, TOX high mobility group box family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOX2Q96NM4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOX2Q96NM4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOX2Q96NM4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms