Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
PRRC1Q96M27 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRRC1Q96M27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms