Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNBD2Q96M20 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNBD2Q96M20 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms