Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms