Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PHACTR3Q96KR7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PHACTR3Q96KR7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms