Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB6

LOXL4, Lysyl oxidase homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL4Q96JB6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LOXL4Q96JB6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LOXL4Q96JB6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms