Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZBED3Q96IU2 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
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