Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAX2Q96IS3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms