Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EDC3Q96F86 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EDC3Q96F86 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms