Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RNF183Q96D59 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RNF183Q96D59 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF183Q96D59 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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