Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EAF2Q96CJ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
EAF2Q96CJ1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EAF2Q96CJ1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EAF2Q96CJ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EAF2Q96CJ1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EAF2Q96CJ1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EAF2Q96CJ1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms