Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NSUN4Q96CB9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN4Q96CB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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