Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
RUNDC1Q96C34 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNDC1Q96C34 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms