Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF34Q969K3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RNF34Q969K3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms