Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SMARCE1Q969G3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMARCE1Q969G3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms