Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KIFAP3Q92845 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KIFAP3Q92845 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms