Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP6NLQ92738 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP6NLQ92738 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms