Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
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RABGGTAQ92696 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABGGTAQ92696 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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RABGGTAQ92696 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABGGTAQ92696 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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