Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RGP1Q92546 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms