Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2AF1L4Q8WU68 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2AF1L4Q8WU68 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms