Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPATA18Q8TC71 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA18Q8TC71 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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