Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NEDD1Q8NHV4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NEDD1Q8NHV4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms