Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
LINC00612Q8N6U2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00612Q8N6U2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms